走進科技抗“疫”一線:3個“疾控人”的40天
來源:中國網(wǎng) 時間:2020-02-28 12:58:20 編輯:陳姝悅
為抗擊新冠肺炎,成都啟動首批8個應急科技攻關(guān)項目,成都市疾控中心承擔的“成都地區(qū)新型冠狀病毒疫情應急響應模式的構(gòu)建及應用”即是其中之一。構(gòu)建成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統(tǒng)、掌握成都市新冠疫情的流行特征、探索成都市新冠病毒肺炎的時空分布規(guī)律……這些,都是這個應急科技攻關(guān)項目中的重要組成部分。
如今,作為抗擊新冠肺炎的“排頭兵”的疾控人,正在和時間賽跑,在一線戰(zhàn)“疫”的同時,群策群力推動應急科技攻關(guān)。他們“連軸轉(zhuǎn)”了1個多月,每天工作超過16個小時,熬過數(shù)不清的夜……而他們的目標只有一個,希望用科技賦能戰(zhàn)“疫”。
如今,作為抗擊新冠肺炎的“排頭兵”的疾控人,正在和時間賽跑,在一線戰(zhàn)“疫”的同時,群策群力推動應急科技攻關(guān)。他們“連軸轉(zhuǎn)”了1個多月,每天工作超過16個小時,熬過數(shù)不清的夜……而他們的目標只有一個,希望用科技賦能戰(zhàn)“疫”。
72小時采集分析系統(tǒng)
在成都市疾病預防控制中心新冠肺炎疫情應急指揮中心,新冠肺炎密切接觸者采集分析系統(tǒng)發(fā)出新的提示。這套密切接觸者數(shù)據(jù)采集分析系統(tǒng)是成都市疾控中心應急與業(yè)務(wù)管理辦公室主任庹曉莉和團隊緊急科研攻關(guān)的成果,從研發(fā)到上線,僅僅用了72小時。
正在運行的這套“成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統(tǒng)”也是成都市疾控中心承擔的科技攻關(guān)項目中的重要一部分,得到了成都市科技局的大力支持,在當下的疫情防控中發(fā)揮了重要作用。
庹曉莉駐守的成都市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應急指揮中心,每天要處理大量信息和指令,串聯(lián)起疫情防控公共衛(wèi)生響應全鏈條,是疾控指揮調(diào)度及信息匯總分析的樞紐,成都市每日新冠肺炎疫情最新情況的數(shù)據(jù)即來源于此。每天工作超過13個小時,有時候甚至通宵加班,電話24小時在線,這早已成為庹曉莉工作的常態(tài)。
對密切接觸者追蹤管理,是疫情防控中的重要環(huán)節(jié)。如何精準的做到信息共享和統(tǒng)計分析,更是成為了疫情決策的關(guān)鍵。
在成都市科技局應急攻關(guān)項目的支持下,庹曉莉和團隊當機立斷,決定在已有的疾病監(jiān)測系統(tǒng)上,新建一個針對新冠密切接觸者的實時采集分析系統(tǒng)。“時間就是生命,我們必須分秒必爭。”庹曉莉說,我和我的團隊每天都見縫插針與研發(fā)團隊商量、討論,修改……目的就是讓這個系統(tǒng)能夠盡快上線。
庹曉莉駐守的成都市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應急指揮中心,每天要處理大量信息和指令,串聯(lián)起疫情防控公共衛(wèi)生響應全鏈條,是疾控指揮調(diào)度及信息匯總分析的樞紐,成都市每日新冠肺炎疫情最新情況的數(shù)據(jù)即來源于此。每天工作超過13個小時,有時候甚至通宵加班,電話24小時在線,這早已成為庹曉莉工作的常態(tài)。
對密切接觸者追蹤管理,是疫情防控中的重要環(huán)節(jié)。如何精準的做到信息共享和統(tǒng)計分析,更是成為了疫情決策的關(guān)鍵。
在成都市科技局應急攻關(guān)項目的支持下,庹曉莉和團隊當機立斷,決定在已有的疾病監(jiān)測系統(tǒng)上,新建一個針對新冠密切接觸者的實時采集分析系統(tǒng)。“時間就是生命,我們必須分秒必爭。”庹曉莉說,我和我的團隊每天都見縫插針與研發(fā)團隊商量、討論,修改……目的就是讓這個系統(tǒng)能夠盡快上線。
僅僅用了3天時間,成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統(tǒng)1.0版上線,它將所有確診病例、疑似病例以及密切接觸者納入一個完整的數(shù)據(jù)庫,分級分類管理,快速追蹤。
獲取密接者信息的速度大大加快了;密切接觸者追蹤管理效率大大提高;信息組數(shù)據(jù)采集匯總分析效能大大增強;……科技化手段對疫情防控工作帶來的效率提升立竿見影。
庹曉莉說:“目前我們管理的密接者累計已達到6000多人,在管的還有數(shù)百余人??梢韵胂?,這么大工作量,如果沒有這個信息系統(tǒng),要完成實時信息共享和精準分析,靠再多的人都實現(xiàn)不了。”
當然,努力并沒有止步于此,庹曉莉和其團隊還在計劃不斷完善系統(tǒng)功能。“一方面,系統(tǒng)采集信息的功能息需要完善。比如,現(xiàn)在關(guān)注‘返港復工’人員的情況,我們的系統(tǒng)也會增加相關(guān)數(shù)據(jù)的采集。另一方面,系統(tǒng)的統(tǒng)計分析的功能也需要不斷完善,為我們深入分析新冠肺炎疫情特征提供支撐。”庹曉莉說,下一步,我們還計劃聚焦數(shù)據(jù)的可視化呈現(xiàn),把“枯燥”的數(shù)字代表的意義表達出來。而在未來,其他的傳染病防控,這套系統(tǒng)也將繼續(xù)發(fā)揮重要作用。
5小時一張“人物關(guān)系圖”
自新冠肺炎疫情爆發(fā)以來,成都市疾控中心流行病學調(diào)查組副組長、傳防科副科長岳勇所帶領(lǐng)的成都市疾控中心流行病學調(diào)查組,就早已奔波各處醫(yī)院、隔離點。而這樣的現(xiàn)場調(diào)查,每一例短則2-3小時,多則甚至要3-5小時。隔著密不透風的防護服,艱難的記錄著每一次問答,他們只為找到“蛛絲馬跡”,迅速確定所有密切接觸者。
岳勇,先后經(jīng)歷了2009年甲型H1N1流感疫情、2014年西非埃博拉暴發(fā)、中東呼吸綜合征、2017年人感染H7N9禽流感等重大的新發(fā)傳染病疫情處置的他,對一線傳染病防控有著豐富的經(jīng)驗。而這次他和他的團隊,也成為了這樣一群在疫情“一線”與時間、與疾病“賽跑”的疾控人。
岳勇和他的團隊,從疫情暴發(fā)以來就一直沖鋒在第一線,白天黑夜連軸轉(zhuǎn),很多時候都把辦公室當家,住在這里。
在本次疾控中心承擔的成都市應急科技攻關(guān)項目中,即提出要“掌握成都市新冠疫情的流行特征”、“通過典型的聚集性疫情案例,探索分析新型冠狀病毒的傳播模式”……而要弄清這些問題,岳勇和他的團隊正在進行的流行病學調(diào)查就至關(guān)重要。
“流調(diào)”即流行病學調(diào)查。學術(shù)上解釋為,用流行病學方法進行的調(diào)查研究。主要用于研究疾病、健康和衛(wèi)生事件的分布及其決定因素。通過這些研究提出合理的預防保健對策和健康服務(wù)措施,并評價這些對策和措施的效果。
“目前我們對新冠病毒的了解有限,還需要不斷的加深認識。這需要我們在開展流調(diào)中,對每一個疑似或者確診病例展開調(diào)查,以盡可能細致地摸清他們的行動軌跡,找到其他密切接觸者,并從流行病學上分析病毒特征,最終形成資料報告。”在岳勇看來,“只有這些工作做的越深入,信息越細致,盡快掌握一手資料,才能為疫情防控提供支撐,并形成有效的防控經(jīng)驗。”
來自岳勇和他團隊提供的“流調(diào)”數(shù)據(jù),是每一天清晨,我們最關(guān)注的信息。“流調(diào)”是一項瑣碎、細致的工作,但是至關(guān)重要,岳勇和他的團隊,如今依然“戰(zhàn)斗”在疫情一線, 而他們形成的一個個“流調(diào)”報告,也正在為科研攻關(guān)提供著有力的數(shù)據(jù)支撐。
用GIS系統(tǒng)探索病毒時空分布規(guī)律
在疾控中心微檢科收樣室,成都市疾控中心科研教育信息管理科副主任杜長慧在緊張有序?qū)徸x區(qū)縣隨同標本一起上交的流調(diào)報告的間隙,還在抓緊時間構(gòu)思測試GIS技術(shù)和時空分析方法在疫情防控中如何發(fā)揮作用。
在他的電腦屏幕上,顯示的是一張成都市地圖,而他所做的,正是希望把新冠病毒的時空分布規(guī)律在地圖上展示出來,為我們更好了解新冠病毒的地域傳播,提供一個新的破題思路。
為了進一步提高流調(diào)報告的質(zhì)量,杜長慧在收樣室審讀上送標本的流調(diào)報告,溝通區(qū)縣流調(diào)人員補充報告中需要完善的地方。從大量的流調(diào)報告中,杜長慧發(fā)現(xiàn)被調(diào)查對象的個體傳播軌跡迫切需要一種展示技術(shù),他邊審讀報告,邊整理個體傳播軌跡的表現(xiàn)形式,一遍又一遍用各種GIS方法和技術(shù)進行研究和測試,以期盡早給出一套成熟的展示技術(shù)用于現(xiàn)在的疫情防控。
作為牽頭人之一,杜長慧和團隊成員已完成了大量的方法和技術(shù)測試和準備,數(shù)據(jù)整理和分析也在有序開展。據(jù)杜長慧介紹,此前團隊也計劃在成都地區(qū)諾如病毒的分子流行病學研究引入GIS系統(tǒng),以研究病毒進化時空分布規(guī)律,已積累了一定的研究基礎(chǔ),此次也希望通過這項技術(shù)為新冠疫情防控提供幫助和支持。
與此同時,經(jīng)過前期收集病例和密接的流行病學信息、采集病例的標本,微生物檢驗科將建立基因測序方法,挑選合格標本進行測序與進化分析,整理并數(shù)字化流調(diào)信息。最終,在GIS系統(tǒng)和分子溯源技術(shù)的助推下,將有望展示新冠病毒的傳播模式及病毒進化的時空分布規(guī)律。
一環(huán)扣一環(huán)的科技攻關(guān),將不僅為我們探索新型冠狀病毒的傳播機制提供研究基礎(chǔ),也將為未來疫情防控與政府決策提供科學依據(jù)。(溫彩苓)